En 1754 en el Colegio de San Luis de Quito, Juan Nieto y Polo del Águila, nombrado obispo de Quito, le confirió el orden sacerdotal.
A la par que nacía el poeta se formaba el sabio en la Universidad jesuita donde tuvo la oportunidad de usar aparatos tan modernos como el microscopio de Luff, con el que realizó importantes experimentos científicos. Fue el primero en afirmar que las enfermedades eran producidas por animalitos y hasta llegó a dibujar bacilos, estreptococos y espiroquetas.
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